Начальник Департамента
Заместитель начальника Департамента
Комитет общего и дополнительного образования
Комитет мониторинга и управления качеством образования
Комитет организационно-кадровой и правовой работы
Общий отдел
Заместитель начальника Департамента по экономическим вопросам
Комитет экономики образования
Отдел бюджетного планирования и статистики
Отдел бухгалтерского учета и отчетности
Заместитель начальника Департамента по развитию инфраструктуры
Отдел обеспечения и безопасности образовательных организаций
Отдел закупок
Комитет по контролю, надзору и лицензированию в сфере образования
Отдел лицензирования и аккредитации
Отдел контроля и надзора